Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P04213 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P04213 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
P04213 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04213 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04213 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04213 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04213 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms