Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtnd1P03888 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms