Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01679 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01679 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01679 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms