Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01669 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01669 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01669 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01669 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01669 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01669 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01669 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01669 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01669 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01669 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
P01669 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01669 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01669 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01669 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01669 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01669 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01669 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01669 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01669 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01669 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01669 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01669 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms