Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01644 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01644 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01644 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01644 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01644 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01644 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01644 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01644 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms