Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp1O89090 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms