Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MscO88940 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MscO88940 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MscO88940 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MscO88940 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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MscO88940 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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MscO88940 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MscO88940 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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