Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmx1bO88609 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmx1bO88609 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms