Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms