Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme6O88425 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms