Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10509O88255 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms