Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms