Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms