Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlx3O55144 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms