Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms