Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms