Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms