Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NlkO54949 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NlkO54949 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NlkO54949 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NlkO54949 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NlkO54949 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NlkO54949 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NlkO54949 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NlkO54949 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NlkO54949 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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NlkO54949 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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NlkO54949 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NlkO54949 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NlkO54949 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NlkO54949 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NlkO54949 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NlkO54949 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NlkO54949 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NlkO54949 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NlkO54949 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NlkO54949 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NlkO54949 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NlkO54949 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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NlkO54949 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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