Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb6O54946 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms