Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn5O54942 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn5O54942 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cldn5O54942 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cldn5O54942 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn5O54942 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn5O54942 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn5O54942 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn5O54942 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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