Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs5O54928 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs5O54928 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms