Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms