Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5r2O35926 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms