Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms