Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms