Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1dO35473 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1dO35473 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1dO35473 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms