Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih1O35372 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms