Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hs3st1O35310 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms