Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms