Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms