Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms