Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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