Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms