Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3aO08665 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms