Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms