Protein–RNA interactions for Protein: L7N200

Gm5152, Predicted gene 5152 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5152L7N200 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5152L7N200 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5152L7N200 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms