Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r88L7N1W8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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