Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3248K7N721 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms