Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r78K7N6U5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r78K7N6U5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms