Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms