Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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