Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms