Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21897J3KMP5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms