Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20696H3BJN7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20696H3BJN7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms