Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms