Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms