Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms