Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms