Protein–RNA interactions for Protein: F6XVS9

Gm8922, Predicted gene 8922, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8922F6XVS9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8922F6XVS9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8922F6XVS9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms