Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm28305F6U473 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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